我重点实验室配备MIDI全自动微生物鉴定系统及环境样品微生物群落分析软件,该软件可自动分析气相色谱测得的环境样品中磷脂脂肪酸(PLFA)的种类和含量,从而实现快速、准确的微生物定性、相对定量与群落结构分析,是环境土壤样品微生物群落结构分析的最佳方法之一。我实验室已配备适量的标准品(型号:1300-C和1208),欢迎有需求的广大师生前来使用。下面就MIDI全自动微生物鉴定系统作以介绍:
SHERLOCK® Microbial Identification System为美国MIDI公司依据自20世纪60年代以来对微生物细胞脂肪酸的研究经验,开发的一套根据微生物中特定短链脂肪酸(C9-C20)的种类和含量进行鉴定和分析的软件,该软件可以操控Agilent公司的6850、7820、6890和7890型气相色谱,通过对气相色谱获得的短链脂肪酸的种类和含量的图谱进行比对,从而快速准确地对微生物种类进行鉴定。
一、MIDI微生物鉴定系统功能:1)、微生物整体上的群落分析,找出优势的菌群及起关键作用的群落(宏观);2)数据后期分类:按脂肪酸种类分类、按菌群分类(宏观)。
1、前处理(重点步骤):磷脂脂肪酸PLFA提取(附件1);
2、上机:安捷伦气相色谱仪 GC7890A分析(附件2);
3、数据分析:MIDI(获得脂肪酸图谱)Pattern recognition software、MIDI(细菌脂肪酸数据库)Microbial databases,数据整理发文结果见下图示例;
4、相关的其它资料见附件:MIDI介绍(附件3)、MIDI 实验所需试剂耗材购买指导(附件4)。
附件4 MIDI 实验所需试剂耗材购买指导.doc
环境科学与工程重点实验室
2018年9月20日